柴胡药材干根DNA提取及RAPD分析

• 作者: 南晓洁 秦雪梅 赵艮贵 郝媛媛 韩榕
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 柴胡 干根 DNA RAPD
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 447-451
• 页数: 5页
• 分类号: R282.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-2670.2009.03.034

摘要

目的 探索一种适用于柴胡药材干根DNA提取的方法,为实现以分子标记方法辨别柴胡药材奠定基础.方法 比较研究了分别用CTAB法、SDS法和高盐低pH法等3种方法提取柴胡样品基因组DNA.柴胡药材干根经过PVP以及TNE缓冲液进行不同的预处理,以CTAB法抽提DNA.以EcoR I/Mse I双酶切琼脂糖凝胶电泳及RAPD扩增检测提取DNA的质量.采用NTSYS-pc软件计算Jaccard遗传相似系数,以非加权配对算术平均数法(UPGMA)建立聚类图.结果 常规DNA提取方法提取药材干根DNA溶液经4℃放置后,黏稠并褐变,严重影响酶切和RAPD扩增.样品预处理优化条件是研磨时加入3%PVP,TNE缓冲液于0℃浸提2次,每次30min.以该优化的预处理方法处理6个柴胡药材干根样品,提取DNA条带清晰,酶切完全,RAPD扩增图谱清晰稳定,共获得有效扩增条带28条,其中多态性条带为20条,占71.43%.聚类分析表明,6个栽培品中,原产地为山西灵丘外地引种(LQWY)和甘肃陇西(LX)、山西灵丘(LQ)和山西方山(FSH)的亲缘关系较近,陕西商洛(SHL)和其他5个栽培品的亲缘关系较远.结论 柴胡药材干根经过预处理后,可采用常规的DNA提取方法抽提DNA,所提DNA适合于酶切、RAPD等分子标记分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦雪梅	山西大学化学生物学与分子工程教育部重点实验室	322	3415	29.0	41.0
2	韩榕	山西师范大学生命科学学院	94	716	14.0	21.0
3	赵艮贵	山西大学化学生物学与分子工程教育部重点实验室	11	87	6.0	9.0
4	南晓洁	山西师范大学生命科学学院	2	37	2.0	2.0
5	郝媛媛	山西大学化学生物学与分子工程教育部重点实验室	3	40	3.0	3.0