抗克伦特罗单链抗体基因构建及蛋白结构模拟

• 作者: 刘细霞 孙远明 沈玉栋 潘科 王弘 雷红涛
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 克伦特罗 单链抗体 结构预测
• 年，卷（期）: 2009,（13）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 227-231
• 页数: 5页
• 分类号: Q786
• 字数: 2427字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-6630.2009.13.052

摘要

目的:构建抗克伦特罗单链抗体(scFv)基因cbl,进行蛋白质结构模拟并对其理化特性进行分析.方法:采用重叠延伸PCR方法,以能特异性分泌抗克伦特罗mAb的杂交瘤细胞株5D1为原料,构建抗克伦特罗scFv基因cbl,进行测序,采用生物信息软件对氨基酸序列推导并进行结构预测,同时对理化性质进行分析.结果:抗克伦特罗scFv基因cbl全长720bp,对应225个氨基酸,单链抗体分子量约为25826.6,等电点预测值8.78,为碱性蛋白质;二级结构显示抗克伦特罗单链抗体含α螺旋20处,β折叠99处,β转角28处,随机卷曲93处.cbl三级结构建模显示重链(VH)和轻链(VL)形成一个疏水的"口袋",Linker游离于此结构之外,符合scFv的结构特点,明显具有抗原结合位点的空间构象,理论上应该具有良好的抗原结合活性.结论:构建一个抗克伦特罗scFv基因cbl,应用信息学技术所获得的预测和分析结果为抗克伦特罗单链抗体的进一步表达、纯化和活性研究提供信息.