嗜酸氧化亚铁硫杆菌的谷胱甘肽还原酶的结构模建和底物分子对接

• 作者: 刘元东 曾乐平 邱冠周
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 谷胱甘肽还原酶 嗜酸氧化亚铁硫杆菌 同源模建 分子动力学 分子对接 黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD) 氧化型谷胱甘肽(GSSG)
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 401-406
• 页数: 6页
• 分类号: Q554
• 语种: 中文

摘要

极端环境微生物嗜酸氧化亚铁硫杆菌的谷胱甘肽还原酶(GR)可能在它的抵抗极端酸性,有毒和氧化性的生物浸出环境中发挥至关重要的作用.通过同源模建技术和分子动力学模拟,它的一个三维结构被构建,优化和检验了.获得的结构被进一步用于搜索绑定位点,跟辅因子黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)和底物谷胱甘肽(GSSG)进行分子柔性对接,并以此识别关健残基.对接结果显示,位于活性残基Cys42和Cys47之间的二硫键夹在FAD的活性位点和底物GSSG的二硫键之间.它们之间的距离非常靠近,这跟底物反应机理的初始步骤的情况十分一致.相互作用能表明8个酶中残基Cys42,Cys47,GIu443B,Glu444B,His438B,Ser14,Thr447B和Lys51是固定或激活GSSG的关键残基,这跟以前的实验事实相吻合.此外,根据相互作用能我们还新发现7个重要残基(Arg449B,Pro439B,Thr440B,Thr310,Va143,Gly46 and Va148).所有这些残基在其它物种中的相应物中也都是保守的.这些结果有助于进一步的实验研究和理解其催化机理,进而揭示这种细菌的抗毒机理,服务于工业应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邱冠周	中南大学湘雅医学院	335	5466	36.0	53.0
2	刘元东	中南大学资源加工与生物工程学院	11	20	3.0	4.0
3	曾乐平		26	165	8.0	10.0