基于序列模式特征和SVM的剪切位点预测

• 作者: 孙贺全 张全伟 彭勤科
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 工学
• 关键词: 序列模式 剪切位点 支撑向量机
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 人工智能及识别技术
• 页码范围: 180-182
• 页数: 3页
• 分类号: TP18
• 字数: 3082字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3428.2009.05.062

摘要

通过对HS3D数据集供点序列碱基的统计分析,利用供体位点邻域碱基出现规律构造模式(motif)作为DNA序列的属性.设置序列属性值将字符序列映射成数字向量,应用支撑向量机进行实验,实现对供体位点的预测分类.实验结果表明,与改进的motif得分模型方法相比,该文方法可有效去除数据中异常数据对分类的影响,将DNA字符序列变换到motif属性数字序列空间具有有效性和实用性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭勤科	西安交通大学电信学院机械制造系统工程国家重点实验室	68	773	16.0	25.0
2	张全伟	西安交通大学电信学院机械制造系统工程国家重点实验室	2	6	1.0	2.0
3	孙贺全	西安交通大学电信学院机械制造系统工程国家重点实验室	1	6	1.0	1.0