合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选

• 作者: 张殿昌 朱彩艳 李小宁 江世贵 苏天凤
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 合浦珠母贝 微卫星 分子标记 多态性位点
• 年，卷（期）: 2009,（15）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 6899-6902,6922
• 页数: 5页
• 分类号: S917
• 字数: 6103字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2009.15.036

摘要

[目的]研究合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选.[方法]采用生物素标记的5个探针,用磁珠富集法构建合浦珠母贝基因组微卫星富集文库,并对文库进行筛选、测序与引物多态性筛选.[结果]对500个克隆进行PCR筛选,测序分析发现130个克隆含有微卫星重复单元.序列比对后最终获得109个具有特异微卫星序列的阳性克隆,其中包含179个微卫星DNA结构域.基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了13对能够在合浦珠母贝基因组有效扩增的微卫星引物,其中8对在种群中(n=32)具有扩增多态性,其多态信息含量PIC值在0.239～0.787;等位基因数在2～9个;观测杂合度介于0.22～0.56;期望杂合度的变化范围为0.25～0.83.[结论]这研究为进一步开展合浦珠母贝的遗传分析提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李小宁	中国水产科学研究院南海水产研究所	2	28	2.0	2.0
5	张殿昌	中国水产科学研究院南海水产研究所	35	385	13.0	18.0
6	朱彩艳	中国水产科学研究院南海水产研究所	20	194	9.0	13.0
7	苏天凤	中国水产科学研究院南海水产研究所	58	1015	17.0	29.0
8	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0