赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析

• 作者: 吴建明 李杨瑞 杨丽涛 杨柳 王爱勤
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 赤霉素 甘蔗 cDNA-SCoT 差异表达
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1883-1890
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01883

摘要

以甘蔗ROC22为材料,在伸长初期进行叶面喷施200 mg L-1浓度的赤霉素为处理,以喷施清水为对照,在不同时间取幼茎样品,用cDNA-SCoT进行基冈差异表达分析.结果表明,通过46条引物筛选了约700个cDNA片段,获得差异片段30个.有18个基因片段受赤霉素上调而12个基冈片段下调;其中16个TDFs序列和NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,按照其功能可分为6类,即能量与代谢相关基因(占总数的20.0%)、未知功能蛋白(占总数的20.0%)、未知基因(占总数的46.7%)、信号传导相关基因(占总数的6.7%)、转录因子相关基因(占总数的3.3%)和细胞凋亡基因(3.3%).这说明利用SCoT方法可以进行蔗茎基因差异表达研究,分离到的一些差异片段可能是与甘蔗节间伸长相关的基因.