沙眼衣原体热休克蛋白60的B细胞表位预测及分析

• 作者: 张丽芳 朱珊丽 林文军 王作鹏 金晓兰 陆丽君
• 来源期刊: 温州医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 沙眼衣原体 热休克蛋白60 B细胞表位 预测
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 436-440
• 分类号: R373
• 字数: 2233字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2138.2010.05.004

摘要

目的:分析沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,CT)热休克蛋白60(heat shock protein 60,HSP60)的二级结构并预测其B细胞优势表位,进一步分析其在沙眼衣原体相关自身免疫性疾病发病中的意义.方法:以CT标准株(E/UW-5/Cx)HSP60的完整氨基酸序列为基础,分别采用SOPMA、GOR、nnPredict 和HNN四种方法预测CHSP60的二级结构,并结合其跨膜区域、亲水性、表面可及性、抗原性、极性和柔韧性等参数进行综合分析,预测CHSP60可能的B细胞优势表位,并将B细胞优势表位与人HSP60的氨基酸序列进行比对,分析两者之间的同源性,寻找可能与自身免疫性疾病相关的B细胞表位.结果:四种方法对CHSP60二级结构的预测表明,其二级结构中柔性区域以无规卷曲为主,少见转角.其B细胞优势表位可能位于氨基酸79～85、135～140、433～440和526～532区域,而上述序列与人HSP60氨基酸序列比对后,发现其135～140、433～440和526～532区域与人HSP60氨基酸159～164,457～464、549～556区域有较高的同源性.结论:CHSP60可能的B细胞优势表位中,135～140、433～440和526～532区域可能与 CT感染相关自身免疫性疾病的发病有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丽芳	温州医学院微生物学与免疫学教研室	74	280	10.0	11.0
2	朱珊丽	温州医学院微生物学与免疫学教研室	23	89	5.0	8.0
3	陆丽君	温州医学院微生物学与免疫学教研室	4	8	2.0	2.0
4	王作鹏	温州医学院第二临床医学院	1	3	1.0	1.0
5	林文军	温州医学院第二临床医学院	1	3	1.0	1.0
6	金晓兰	温州医学院第二临床医学院	1	3	1.0	1.0