利用RT-PCR技术验证基于小鼠外显子芯片发现的缺血相关基因的表达

• 作者: 任长虹 刘虎岐 周瑞 张成岗 杭兴宜 王稳
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 可变剪接 外显子 外显子芯片 缺血相关基因 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 299-303
• 分类号: Q78|Q52
• 字数: 3199字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2010.03.001

摘要

目的:利用RT-PCR技术验证并确认基于小鼠外显子芯片发现的部分缺血相关基因的表达,以鉴定候选基因的外显子是否发生可变剪接,从而实现对外显子芯片结果的鉴定.方法:根据生物信息学分析结果,选取小鼠外显子芯片中的3个基因(Ube3c,6330439K17Rik,Atp7a),在预测发生可变剪接的外显子两侧设计上下游引物,PCR后进行凝胶回收,再克隆到载体中进行测序.结果:RT-PCR及测序结果表明,Ube3c基因在6号外显子、6330439K17Rik基因在12号外显子、Atp7a基因在3号外显子发生可变剪接,与芯片预测结果一致.结论:RT-PCR技术可针对外显子芯片的结果进行可靠性验证,为可变剪接基因表达研究提供了一种有效手段.