长江下游4属6种鳞科鱼类线粒体16S rDNA部分序列的比较分析

• 作者: 秦钦 葛家春 蔡永祥 许志强 边文冀 陈校辉 霍光明
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲿科 16S rDNA 分子系统学
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 373-376
• 分类号: S965.199
• 字数: 3034字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2010.02.027

摘要

采用PCR扩增获得了长江下游鲿科(Bagridae)4个属6个种类的线粒体16S rDNA序列片段.序列长度介于920 bp与933 bp之间,A+T含量明显高于C+G含量.共有939个比对位点,其中190个为变异位点;52个为简约信息位点.以大鳞脂鲤(Chalceus macrolepidotus)为外群,采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)分析鳞科4属6种鱼类的系统发生关系.结果表明,16S rDNA序列可以作为鲿科属间系统发育分析的有效分子标记.聚类结果显示,鲿科鱼类构成一个单系类群,其中鳠属(Mystus)较特化,黄颡鱼属(Pelteobagrus)次之,而拟鲿属(Pseud-obagrus)与鮠属(Leiocassis)的亲缘关系最近.