基于12SrRNA序列研究龟鳖类的系统进化特征

• 作者: 万全 程起群 赵金良 郑将臣
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 龟鳖类 12SrRNA基因 遗传趋异 分子分类 系统进化
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 264-275
• 分类号: Q959.6+3
• 字数: 5086字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-2490.2010.03.006

摘要

为研究龟鳖类的系统进化关系,以期为龟鳖类的保护和合理开发利用提供基础资料,测定了15种龟类线粒体12SrRNA 基因片段的序列.比对后获得一致序列长为433 bp,有191个变异位点,总变异率为43.2%,其中简约信息位点108个.A、T、G、C的平均含量分别为21.46%、34.42%、25.85%和18.27%.A+T含量(55.9%)高于G+C含量(44.2%).在433个核苷酸位点中,有插入/缺失35个,转换为34,颠换为21,转换/颠换比率为1.67.与NCBI上其它一些龟鳖的序列进行比对后,得到414 bp的一致序列,其中236个为变异位点,总变异率为57.00%;简约信息位点181个.A、T、G、C的平均含量分别为35.7%、22.2%、18.1%、24.0%.A+T含量(57.9%)高于G+C含量(42.1%).在414个核苷酸位点中,转换为30,颠换为14,转换/颠换比率为2.12.基于Kimura双参数模型分析龟鳖类种间、属间、科间遗传距离,并用邻接法构建分子系统树.结果显示:7种闭壳龟种间差异在0～0.043,平均为0.022;淡水龟科属间遗传距离为0.007～0.140,平均为0.074;曲颈龟亚目9个科间(不包括平胸龟)遗传距离为0.055～0.197,平均为0.139.由此认为,淡水龟科与陆龟科亲缘关系比龟科更近;不支持将闭壳龟属拆分为闭壳龟属和盒龟属;支持将平胸龟属归为鳄龟科的一个属.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	万全	安徽农业大学动物科技学院	97	595	13.0	20.0
2	赵金良	上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室	64	384	11.0	14.0
3	程起群	农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	8	156	6.0	8.0
4	郑将臣	农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	2	17	2.0	2.0