黄瓜抗白粉病品系cDNA文库构建及EST分析

• 作者: Mouammar Alfandi 徐强 罗晶晶 陈学好 马威 齐晓花
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 白粉病 cDNA文库 EST
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 931-938
• 分类号: S642.2
• 语种: 中文

摘要

采用SMART技术构建了高抗白粉病的黄瓜品系JIN5-508的叶片cDNA文库,并对其进行了质量鉴定.结果表明,该文库的重组率为95.3%,库容量为1.02×106pfu·mL-1,平均插入片段为0.5 kb左右,是一个高质量的cDNA文库.利用该文库随机挑选的8 352个克隆从5'端进行单向测序,共获得8 035个有效的ESTs(expressed sequence tags),序列的平均长度为838 bp.进一步的生物信息学分析表明:EST序列拼接出3 467个unigenes,其中包括953个contigs和2 514条singletons,文库冗余度较低,为56.9%;从文库中筛选出了大量的低丰度表达基因,约占unigene总数的72.5%,说明文库的复杂性较高;1 991个unigenes获得分子功能注释,其中与蛋白结合活性和催化活性相关的基因分别达到了41.34%和38.72%;在获得功能注释的unigene中,有部分抗病抗逆相关基因高丰度表达,其中3个unigenes与拟南芥白粉病抗性基因Mlo2、Mlo8和Mlo14高度同源,表明该文库可为进一步研究黄瓜抗白粉病相关的特异基因的克隆及功能验证奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈学好	扬州大学园艺与植物保护学院	118	1717	22.0	38.0
2	徐强	扬州大学园艺与植物保护学院	56	650	16.0	24.0
3	齐晓花	扬州大学园艺与植物保护学院	29	158	8.0	12.0
4	Mouammar Alfandi	扬州大学园艺与植物保护学院	3	24	3.0	3.0
5	罗晶晶	扬州大学园艺与植物保护学院	4	69	4.0	4.0
6	马威	扬州大学园艺与植物保护学院	1	5	1.0	1.0