鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位

• 作者: 刘春雷 刘金亮 常玉梅 徐丽华 梁利群 高国强
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲤鱼 表达序列标签 耐低温 相关分析 连锁图谱
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 581-586
• 分类号: Q959.468|Q343.1|Q311.8|Q16|Q958.1124
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2010.06581

摘要

利用GLM模型对12个表达序列标签(expressed sequence tag,EST)标记的基因型与鲤耐低温性状进行相关性分析,然后使用OneMap软件将这些EST标记进行连锁定位研究,并通过Blast x搜索引擎对这些候选EST进行注释.结果显示,EST标记CC009(P<0.05)和CC115(P<0.01)与鲤鱼耐低温性状显著相关;12个EST标记中有8个标记分别连锁定位到6个连锁群中,其中与耐低温相关的CC009和CC115分别定位到鲤连锁图谱的第38号连锁群和第2号连锁群;蛋白质数据库同源性比对发现,CC009与斑马鱼(Danio rerio)尿嘧啶激酶1(uridine-cytidinekinaseI)的同源性高达94%;而CC115为原绿球藻(Prochlorococcus marinus str)的假定糖基转移酶(pulative glycosyltransferase)的同源性为56%.