黑尾地鸦线粒体基因组序列测定与分析

• 作者: 柯杨 雷富民 黄原
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑尾地鸦 线粒体基因组 rRNA二级结构 控制区
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 951-960
• 分类号: Q95
• 字数: 6463字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00951

摘要

采用长PCR扩增的线粒体DNA和引物步移法, 测定并注释了中国特有鸟类-黑尾地鸦(Podoces hendersoni)的线粒体基因组全序列.黑尾地鸦的mtDNA序列全长16 867 bp, GenBank登录号GU592504.基因含量和排列次序与原鸡的一致,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和1个控制区(D-loop).除COI基因以GTG作为起始密码子外, 其余12个蛋白质编码基因均以典型ATG密码子起始.11个蛋白编码基因以完全终止密码子TAA、AGG或AGA终止, COIII和ND4基因终止密码子为不完整的T.tRNASer(AGY)的DHU臂缺失, tRNALeu(CUN)的反密码子环由9个碱基构成, 而不是标准的7个碱基.其余的20个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构.预测了rRNA的二级结构, 其中, 12S rRNA二级结构包含4个结构域, 43个茎环结构; 16S rRNA的二级结构包含6个结构域, 55个茎环结构.此外, 在其他鸟类控制区中所发现的F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box也同样存在于黑尾地鸦中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雷富民	中国科学院动物研究所动物系统与进化重点实验室	68	1093	20.0	30.0
2	黄原	陕西师范大学生命科学学院	84	847	16.0	24.0
3	柯杨	陕西师范大学生命科学学院	1	15	1.0	1.0