鼠疫菌基因组"默认编码序列"数据库的建立与初步研究

• 作者: 俞东征 张恩民 海荣 王琪 申小娜 陈晨
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 鼠疫耶尔森菌 序列分析 编码序列
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 436-438,446
• 分类号: R516.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2010.06.005

摘要

目的 对8株鼠疫耶尔森菌全基因组间编码序列进行比对,寻找鼠疫菌中最普遍存在的编码序列,建立"默认编码序列"数据库.方法 应用Blast软件、Ped编程及Excel软件等,对8株已测序全基因组编码序列进行比对和统计.结果 建立了"默认编码序列"数据库,共有4271个编码序列.其中8株鼠疫菌核苷酸(氨基酸)完全一致的编码序列为1176个;对应的编码序列只存在1种"默认编码序列"的是2465个;存在2种"默认编码序列"的是630个.结论 "默认编码序列"数据库是鼠疫菌中最普遍存在的编码序列集合,为进一步深入研究鼠疫菌的遗传特征提供了可靠信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王琪		1	2	1.0	1.0