2009年广东省肠道病毒71型vp1区全序列分析

• 作者: 张万里 曾汉日 柯昌文 柳正 苏娟 马聪 黎薇
• 来源期刊: 华南预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 基因
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 14-18
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

目的 研究广东省2009年肠道病毒71型的基因特征及流行趋势.方法 收集广东省各地市手足口病病例的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液和脑脊液等肠道病毒71型核酸阳性标本进行病毒分离及鉴定,选取粤东、粤西、粤北、珠三角4个地区16例病例的16株代表株进行vp1区全序列片段扩增,并运用DNASTAR 6和MEGA 4.02软件,将16株代表株的vp1全序列与从GenBank中下载的肠道病毒71型各代表基因型(亚型)进行同源性分析,并构建系统发生树.结果 所选16株代表株经vp1区全序列片段扩增,扩增片段长度为1 042 bp,经测序和拼接后获得的序列片段长度为891 bp.16株代表株与肠道病毒71型A型和B型的亲缘性较远,核苷酸和氨基酸的同源性分别在81.5%~84.6%和94.3%~97.0%之间;与C型的亲缘性较近,核苷酸和氨基酸的同源性分别在87.4%~93.5%和97.6%~99.3%之间,其中与C4亚型的亲缘性最近,核苷酸和氨基酸的同源性分别在92.5%~93.5%和98.3%~99.3%之间.构建系统发生树表明,该16株代表株与国内外C4亚型处于同一簇,属肠道病毒71型的C4基因亚型C4a群.结论 广东省2009年肠道病毒71型的流行株属于C4亚型,为C4亚型的C4a群,且全省范围内均有流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柯昌文		154	1211	18.0	26.0
2	马聪		8	13	1.0	3.0
3	张万里		13	46	3.0	6.0
4	黎薇		16	79	6.0	8.0
5	曾汉日		21	75	6.0	8.0
6	柳正		1	0	0.0	0.0
7	苏娟		7	15	1.0	3.0