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应用基因芯片检测喉鳞状细胞癌甲醛固定石蜡包埋组织microRNA表达谱
应用基因芯片检测喉鳞状细胞癌甲醛固定石蜡包埋组织microRNA表达谱
作者:
刘宇
张宗敏
张开泰
徐震纲
李琳
薛丽燕
邸雪冰
邹霜梅
韩迺珺
高燕宁
魏明辉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
喉肿瘤
癌,鳞状细胞
肿瘤转移
微RNAs
寡核苷酸序列分析
摘要:
目的 建立以甲醛固定石蜡包埋组织为材料、基于基因芯片技术的microRNA(miRNA)表达谱的分析方法 ;筛选与喉鳞状细胞癌(简称喉癌)生物学特征密切相关的差异表达miRNA.方法 从喉癌甲醛固定石蜡包埋组织中制备总RNA,经质量鉴定后进行荧光标记.采用Agilent公司的容纳723条人类miRNA探针的基因芯片完成杂交实验,以获得喉癌的miRNA表达谱.以GeneSpring GX和R-Project软件处理分析基因芯片实验数据,筛选与喉癌转移相关的差异表达miRNA.结果 从24例甲醛固定石蜡包埋组织标本中获得了符合基因芯片实验质量标准的RNA样品,并完成了基因芯片杂交及数据分析.从中共鉴定到319个miRNA,有96个miRNA在24例喉癌中均有表达,其中与淋巴结转移密切相关的(检错率<0.05)差异表达miRNA有5个,分别为miR-23a* 、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425.结论 甲醛固定石蜡包埋组织可以提供符合基因芯片分析质量要求的miRNA,是研究miRNA的重要样品资源.从喉癌的miRNA表达谱中筛选出的转移相关差异表达miRNA(miR-23a*、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425)有可能成为评估喉癌转移风险的新型分子标志.
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篇名
应用基因芯片检测喉鳞状细胞癌甲醛固定石蜡包埋组织microRNA表达谱
来源期刊
中华病理学杂志
学科
医学
关键词
喉肿瘤
癌,鳞状细胞
肿瘤转移
微RNAs
寡核苷酸序列分析
年,卷(期)
2010,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
391-395
页数
分类号
R73
字数
4330字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.0529-5807.2010.06.007
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喉肿瘤
癌,鳞状细胞
肿瘤转移
微RNAs
寡核苷酸序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华病理学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0529-5807
CN:
11-2151/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-56
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
6261
总下载数(次)
13
总被引数(次)
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