5个重庆地方猪种遗传多样性的微卫星分析

• 作者: 付文贵 何道领 刘文 张亮 王可甜 王金勇 白小青 范首君 蓝静 赵久刚 郭宗义 陈四清 陈磊
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 地方猪种 遗传多样性 微卫星标记 遗传距离 聚类分析
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1515-1522
• 分类号: S828|Q345.6
• 字数: 4742字
• 语种: 中文

摘要

为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系,采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记,以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标,评估了品种内遗传变异.计算了F统计量、Nei氏遗传距离(Da)和Nei氏标准遗传距离(Ds)并进行UPGMA和M聚类分析及主成分分析,进而探讨了品种间的遗传分化和亲缘关系.结果,27个微卫星座位共检测到542个等位基因,其中43个等位基因为单一品种所特有.5个猪种的遗传多样性丰富:有效等位基因数(Ne)在9.493 3～11.028 0之间,期望杂合度(He)在0.889 7～0.909 1之间,多态信息含量(PIC)在0.868 9～0.892 6之间.F统计量分析表明,重庆地方猪种遗传分化明显(P<0.001),各群体内存在一定程度的近交.2种聚类方法以NJ法更为町靠.5个猪种聚为两类,荣昌猪、渠溪猪和合川猪为一类,罗盘山猪和盆周山地猪为一类.相关性分析表明,遗传距离与地理距离闯无显著的相关(P>0.05).该研究结果为重庆地方猪种的保护和利用提供了重要的理论依据.