罗非鱼谷胱甘肽过氧化物酶1基因的克隆与分析

• 作者: 刘振兴 张建騑 曹艳林 林敏 柯浩
• 来源期刊: 南方水产
• 学科: 生物学
• 关键词: 罗非鱼 谷胱甘肽过氧化物酶1 基因克隆
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 52-57
• 分类号: Q785
• 字数: 3481字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-2227.2010.03.010

摘要

采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术,克隆了罗非鱼(Oreochromis niloticus)谷胱甘肽过氧化物酶1(glutathione peroxidase1,GPx1)基因完整的编码序列(complete coding sequence,CDS).GPx1基因全长984 bp,5′UTR 56 bp,CDS 576 bp,3′UTR 352 bp,PolyA 20 bp;第791～885位碱基(位于3′UTR)形成1个硒半胱氨酸插入序列(selenocysteine insertion sequence,SECIS),协助174～176位密码子TGA(UGA)编码1个硒半胱氨酸(Sec).GPx1包含191个氨基酸,分子量21.8 kDa,等电点8.04,无信号肽和潜在的N-糖基化位点.蛋白结构分析表明该基因编码蛋白为非跨膜蛋白.序列比对显示,GPx1单体具有Sec、Trp、Gln和Asn构成的催化四联体.罗非鱼GPx1与其他脊椎动物GPx1相比较,核苷酸序列相似性为43.2%～58.2%,氨基酸序列相似性为58.1%～80.6%.进化分析显示,处在分类学上不同纲的脊椎动物GPx1分别占据了不同分支.利用Swiss-Model预测了罗非鱼GPx1的3D结构,序列分析显示,GPx1可以形成1个同源四聚体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘振兴	广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室	5	56	4.0	5.0
2	林敏		5	63	5.0	5.0
5	柯浩	广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室	12	136	7.0	11.0
6	曹艳林	广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室	2	15	2.0	2.0
10	张建騑	广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室	1	9	1.0	1.0