溶藻弧菌诱导凡纳滨对虾消减文库的构建及其表达序列标签分析

• 作者: 吴灶和 王蓓 简纪常 蔡双虎 蔡小辉 鲁义善
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 凡纳滨对虾 溶藻弧菌 抑制消减杂交(SSH) 表达序列标签(EST)
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 157-163
• 页数: 7页
• 分类号: Q785
• 字数: 4399字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2010.00157

摘要

利用抑制消减杂交技术构建了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)诱导的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)血淋巴细胞cDNA文库.用DNAMAN 5.2.2软件对560条高质量的ESTs进行聚类,共获得239个Unigenes.与GenBank进行BLASTx和BLASTn同源比较,其中66.9%为已知功能基因,33.1%为未知功能基因,GO分类将其分为7类,包括能量和基础代谢类相关的基因为第一大类占36%,免疫相关基因占15%,其他基因占8%.信号转导类占3%,抗氧化酶和凋亡相关蛋白均为2%,核蛋白类占1%.实验结果表明凡纳滨对虾在溶藻弧菌诱导下可产生一系列特异基因的表达,通过对文库的分析显示,基于PCR方法建立的SSH文库为取得大量免疫相关基因的ESTs序列提供了可能.