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摘要:
利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Green I Real Time PCR引物设计程序E-qPCR-Design1.0高通量设计21,118对SYBR Green I Real Time PCR引物,同时选取5 000条基因进行SYBR Green I Real Time PCR引物验证,95.92%的基因引物取得良好效果,1.64%的基因引物产生引物二聚体,1.08%的基因引物有非特异性扩增,通过生物信息技术分析与实验验证,建立了基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库.
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文献信息
篇名 基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库的构建
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 RefSeq转录本数据库 实时定量PCR
年,卷(期) 2010,(2) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 139-141
页数 分类号 Q51
字数 2289字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.02.010
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 周贵良 1 0 0.0 0.0
2 洪来法 1 0 0.0 0.0
3 梁敏玲 1 0 0.0 0.0
4 郑柳城 1 0 0.0 0.0
5 陈转贤 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
RefSeq转录本数据库
实时定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
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