大豆重组自交系群体NJRIKY遗传图谱的加密及其应用效果

• 作者: 周斌 盖钧镒 邢邯 陈受宜
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 大豆 遗传连锁图谱 SSR标记 QTL
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 36-46
• 页数: 11页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.00036

摘要

作物基因组研究,包括基因或数量性状位点(QTL)定位、图位克隆以及物理图谱构建等,首先必须建立具有丰富标记信息的高密度遗传连锁图谱.由科丰1号和南农1138-2杂交组合衍生的重组自交系群体NJRIKY已经构建了4张大豆遗传连锁图谱,但由于遗传信息和标记数目不够充分.在基因和QTL作图时仍然存在精确度和准确度问题.为增加NJRIKY图谱密度,本研究在967对SSR引物中获得了401个多态性SSR标记.结合其他分子数据,使用作图软件Mapmaker/Exp 3.0b,获得一张含有553个遗传标记,25个连锁群,总长2 071.6 cM,平均图距3.70 cM的新遗传连锁图谱,其中SSR标记316个,RFLP标记197个,EST标记39个,形态标记1个.连锁群上大于20 cM的标记间隔由原来42个减少到2个.原图谱的3个SMV抗性基因定位于Dlb连锁群末端的开放区间上且仅与一个RFLP标记连锁,利用加密图谱对Rsc-3、Rsc-7、Rsc-9、Rsc-13、Rsα、Rn1和Rn3等7个SMV抗性基因重定位,全部位于D1b连锁群,与相邻分子标记距离均小于6 cM,其中Rsc-9、Rn1、Rsa的距离小于1 cM,Rsc-13与EST标记GMKF168a共分离.对本群体农艺性状进行QTL重定位,获得8个性状相关的42个主效QTL,其中20个QTL遗传贡献率大于10%,与原图谱比较,新定位的各QTL的标记区间明显缩短,与相邻标记的连锁更加紧密.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈受宜	中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室	80	4570	34.0	67.0