应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性

• 作者: 崔红 李赟 王娜 王崇明 蔡玉勇
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: PCR-DGGE 18S rDNA序列 真核浮游生物多样性
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 51-56
• 分类号: S917.1
• 字数: 4201字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2010.12.008

摘要

为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1～V3区的高变区序列.筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析町将不同藻种分离开.随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带.其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%.不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632.相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微牛物种类相似性最高,为89.7%.基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赟	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	48	532	14.0	20.0
2	王崇明	中国水产科学研究院黄海水产研究所	30	428	12.0	20.0
3	王娜	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	25	208	8.0	14.0
4	蔡玉勇	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	10	81	6.0	9.0
8	崔红		4	31	2.0	4.0