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灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O 片段的克隆与生物信息学分析
灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O 片段的克隆与生物信息学分析
作者:
全鑫
杨丽荣
薛保国
达楞巴雅尔
闫海霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
灰斑古毒蛾核型多角体病毒
EcoR I-O片段
egt基因
Ol-129同源基因
摘要:
分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoR I-O 片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据.克隆和分析了OrerNPV EcoR I-O 片段所包含的2个基因,并应用生物软件对OrerNPV蜕皮甾体尿苷二磷酸葡糖转移酶(egt)基因及其启动子进行了比对分析.结果表明OrerNPV EcoR I-O片段包含egt基因和Ol-129同源基因,在该区域中编码egt基因的开放阅读框(ORF)由1 539个核苷酸组成,可以编码512个氨基酸,预计蛋白质分子质量为57.9 kDa.OrerNPV和NPVs之间的同源性为46%~89%,与白斑天幕毛虫核型多角体病毒(Orgyia leucostigma NPV,OlNPV)egt基因同源性最高,达89%,与棉褐带卷叶蛾核型多角体病毒(Adoxophyes orana NPV,AoNPV)同源性最低为46%;而OrerNPV和 GVs 之间的同源性为 44%~55%,小于与NPVs之间的同源性;与昆虫UGT间同源性最低,与家蚕UGT间同源性为41%.EcoR I-O片段+M13端含有编码OlNPV ORF129(Ol-129)Ol-129同源基因ORF,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子ATG上游-64,-24 nt处各有1个TATA box,其推测的氨基酸序列与Ol-129同源性最高达81%,与LdNPV ORF127同源性最低,为40%.明确了OrerNPV EcoR I-O 片段的序列特征,以及OrerNPV egt 基因特性.
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篇名
灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O 片段的克隆与生物信息学分析
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
灰斑古毒蛾核型多角体病毒
EcoR I-O片段
egt基因
Ol-129同源基因
年,卷(期)
2010,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
55-60
页数
6页
分类号
S432.1
字数
3247字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
全鑫
河南省农业科学院植物保护研究所
16
134
7.0
11.0
2
薛保国
河南省农业科学院植物保护研究所
22
146
7.0
11.0
3
杨丽荣
河南省农业科学院植物保护研究所
14
108
5.0
10.0
4
闫海霞
河南省农业科学院植物保护研究所
5
22
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达楞巴雅尔
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EcoR I-O片段
egt基因
Ol-129同源基因
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华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
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国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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