6种鸡形目和雁形目禽类Mx蛋白编码基因的适应性进化

• 作者: 张学余 朱云芬 李慧芳 束婧婷 陈宽维 韩威
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禽类 抗粘液病毒基因 密码子置换模型 适用性进化
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 10-14
• 分类号: S811.5
• 字数: 3290字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2010.03.003

摘要

为进一步了解禽类Mx基因(myxo-virus resistance gene)进化历程,结构与功能变异及筛选新的潜在抗性位点.根据GenBank中已报道的6种鸡形目(galliform)和雁形目(anseriform)禽类Mx基因编码序列,联配后进行最适核苷酸替代模型筛查,序列重组事件和核苷酸替换的饱和性检验;并采用最大似然法检测各位点承受的选择压力.AIC信息量准则检验结果表明6种鸡形目和雁形目禽类Mx基因的最优核苷酸替代模型为"GTR+G",核苷酸替换的饱和性检测结果表明序列的核苷酸替换并未饱和.单一断裂点(single breakpoint)和遗传算法扫描(GARD)在联配序列中发现两个断裂点,分别位于162bp和999bp处,将联配序列分为3个独立非重组部分.密码子置换模型的"位点特异模型"检测到禽类Mx基因编码序列承受了正选择作用,似然比检验(LRT)确定模型M2a和M8为正选择位点优先检测模型(P<0.05,P<0.01),分别在3部分非重组序列中检测到4个、1个和3个后验概率大于95%的正选择位点,正选择位点主要分布于禽类Mx蛋白特有的N-端结构域和Mx蛋白抗病毒作用所必须的三联GTP酶结合区,可能与Mx蛋白的抗病毒活性有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张学余	中国农业科学院家禽研究所	86	882	17.0	25.0
2	李慧芳	中国农业科学院家禽研究所	143	1590	23.0	32.0
3	陈宽维	中国农业科学院家禽研究所	148	1622	23.0	31.0
4	韩威	中国农业科学院家禽研究所	59	332	10.0	14.0
5	束婧婷	中国农业科学院家禽研究所	31	158	8.0	10.0
6	朱云芬	中国农业科学院家禽研究所	27	151	8.0	10.0