基于FIASCO技术的合浦珠母贝微卫星标记分离与筛选研究

• 作者: 喻达辉 曲妮妮 童金苟 黄桂菊 龚世园
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: FIASCO法 合浦珠母贝Pinctada fucata 微卫星标记 分离与筛选
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 47-54
• 分类号: S91
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2010.03.007

摘要

用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了合浦珠母贝Pinctada fucata基因组微卫星标记的分离与筛选研究.合浦珠母贝基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接, 用生物素标记的(CA)15探针与其杂交, 然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段, 经PCR扩增后形成双链, 最后进行克隆转化, 构建微卫星富集文库.挑选克隆用探针引物(CA)15 和载体引物进行第2次筛选, 获得阳性克隆357个, 测序结果表明, 297个克隆(83.2%)含有微卫星序列, 包括479个微卫星DNA结构域.其中完美型微卫星有370个(77.3%), 非完美型95个(19.8%), 复合型14个(2.9%).合成引物49对, 有31对(63%)扩增出目的产物, 其中9 对在种群中(n=32)具有扩增多态性, 其多态信息含量PIC值在0.375―0.809之间, 平均为0.536;等位基因数在2―9个之间, 平均为4.889个;观测杂合度介于0.200―0.600之间, 平均为0.415;期望杂合度的变化范围为0.454―0.844, 平均为0.598.表明FIASCO技术适合于合浦珠母贝微卫星标记的分离与筛选.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	喻达辉	中国水产科学研究院南海水产研究所	55	800	18.0	26.0
2	童金苟	中国科学院水生生物研究所	22	625	11.0	22.0
3	黄桂菊	中国水产科学研究院南海水产研究所	25	411	13.0	20.0
4	曲妮妮	中国水产科学研究院南海水产研究所	3	94	3.0	3.0
8	龚世园	华中农业大学水产学院	81	1142	22.0	29.0