两栖动物线粒体基因组tRNA基因重复、丢失及其影响

• 作者: 夏云 彭锐 曾晓茂 郑渝池
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 两栖类 线粒体基因组 密码子使用偏好 tRNA基因重复 tRNA基因丢失
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 822-827
• 页数: 6页
• 分类号: Q959.506
• 语种: 中文

摘要

在脊椎动物线粒体基因组中,偶有tRNA基因重复或丢失事件发生,这些事件因与相应氨基酸转运密切关联而凸显重要.两栖类中,这些重复或丢失相对多样,可为相关研究提供良好素材.为了解这些事件对氨基酸对应的密码子使用偏好是否产生影响,本文引入统计方法,检测10种两柄类mtDNA蛋白编码基因相对的同义密码子使用度(RSCU),并特别设计将发生tRNA基因重复或丢失物种与其近缘群进行对比分析.结果显示,tRNA基因的重复对密码子使用偏好没有显著的影响,推测可能与突变积累的时限和mtDNA紧凑性有关.另外,tRNA基因丢失也未使相应氨基酸密码子使用偏好产生明显的改变.推测在两栖类中,"tRNA转入"和"tRNA反密码子摆动位点的超级摆动"可能是tRNA基因丢失的补偿方式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑渝池	中国科学院成都生物研究所	10	52	5.0	7.0
2	曾晓茂	中国科学院成都生物研究所	28	371	10.0	18.0
3	夏云	中国科学院成都生物研究所	11	39	3.0	6.0
4	彭锐	中国科学院成都生物研究所	5	60	2.0	5.0