猪札幌病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用

• 作者: 华修国 康雁君 杨世兴 沈权 陈琰
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪札幌病毒 TaqMan探针 荧光定量RT-PCR
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 246-250
• 页数: 5页
• 分类号: S854.43|S852.659.6
• 字数: 2999字
• 语种: 中文

摘要

根据猪札幌病毒(Porcine Sapovirus,SaV)的VP1保守基因序列设计引物和探针,通过对荧光定量RT-PCR反应条件的优化,建立了TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法,并与常规RT-PCR检测方法进行了比较.结果表明,荧光定量RT-PCR方法的检测灵敏度可达16.1拷贝·μL~(-1),而常规RT-PCR方法的灵敏度为1.61×10~3拷贝·μL~(-1).对216份粪样的检测结果进一步表明该法(检出4份)比常规RT-PCR方法(检出3份)的灵敏度高.系统进化分析表明,该4株病毒均为GⅢ型,与SaV上海分离株(FJ387164)同源性为100%.该方法具有灵敏度高、特异性强、操作简便等优点,适合于猪SaV感染的流行病学调查和临床诊断.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	华修国	上海交通大学农业与生物学院	155	1291	18.0	27.0
2	沈权	上海交通大学农业与生物学院	5	16	3.0	4.0
3	陈琰	上海交通大学农业与生物学院	9	43	3.0	6.0
4	杨世兴	上海交通大学农业与生物学院	1	3	1.0	1.0
5	康雁君	上海交通大学农业与生物学院	1	3	1.0	1.0