甘蓝KAPP编码基因的克隆与序列分析

• 作者: 任雪松 吴韦铷 唐章林 朱利泉 李成琼 杨昆 王小佳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 自交不亲和性 信号转导 KAPP基因 甘蓝
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1067-1074
• 分类号: S6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01067

摘要

采用PCR、RT-PCR及其他分子生物学方法,以甘蓝基因组DNA、花蕾RNA和叶片RNA为模板,分别对甘蓝KAPP gDNA和KAPP cDNA进行扩增,分别获得3 247 bp的KAPP gDNA片段、1 699 bp的KAPP cDNA片段、1 578 bp的花蕾KAPP2 cDNA片段和1 581 bp的叶片KAPP2 cDNA片段.对克隆的甘蓝KAPP gDNA和cDNA(结合报道的KAPP cDNA)进行比对表明,甘蓝KAPP基因包含11个内含子,均符合"GU-AG"剪接规则,并且克隆得到的KAPP cDNA序列与报道的KAPP cDNA序列有6处单个碱基的差异,但两者的氨基酸序列完全一致.然而花蕾KAPP2 cDNA、叶片KAPP2 cDNA片段与报道的KAPP cDNA序列相似性分别为85.2%和85.0%.这两个序列分别在590 bp和593 bp处较早出现一个无义突变引起的终止密码子.Blast分析表明,两基因编码的氨基酸序列与拟南芥KAPP氨基酸序列相似性最高,其次为甘蓝KAPP氨基酸序列.以已报道的8种植物KAPP的CDS及本实验所克隆的两个KAPP2序列构建分子进化树,获得序列与甘蓝KAPP序列聚为一支.结合比较作图及分子进化树,推测KdPP基因在甘蓝基因组上有两个拷贝,而笔者克隆到的KAPP2 cDNA序列是其中一个拷贝,是KAPP进化过程中突变失活的拟基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王小佳	西南大学蔬菜学实验室	50	374	12.0	16.0
2	任雪松	西南大学蔬菜学实验室	26	117	6.0	9.0
3	朱利泉	西南大学植物生理生化实验室	66	505	13.0	19.0
4	李成琼	西南大学蔬菜学实验室	33	316	10.0	16.0
5	杨昆	西南大学植物生理生化实验室	27	125	7.0	10.0
6	唐章林		3	69	2.0	3.0
7	吴韦铷	西南大学植物生理生化实验室	1	3	1.0	1.0