植物β-胡萝卜素羟化酶的生物信息学分析

• 作者: 周春华 孔芬 曹春燕 赵大球 陶俊
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物 β-胡萝卜素羟化酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 116-121
• 页数: 6页
• 分类号: Q94
• 字数: 3600字
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学方法对GenBank中的拟南芥、玉米、龙胆、福寿草和水仙等植物β-胡萝卜素羟化酶(BCH)的核苷酸和氨基酸序列进行了比对分析,进而对其组成成分、理化性质、信号肽、亚细胞定位、疏水性/亲水性、跨膜结构域、功能结构域、基序及蛋白质二级结构等重要参数进行了预测和分析.结果表明,BCH基因全长约为1 256 bp,具有完整的开放阅读框,长约为943 bp,编码313个氨基酸,分子量为34.82 kD,理论等电点为9.18,含量最丰富的氨基酸都包含Ala(10.34%)、Leu(8.7%)和Gly(8.1%);无信号肽,定位于叶绿体中的亲水性不稳定蛋白,含有3-4个跨膜结构域,一个功能结构域,二级结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主要构件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵大球	扬州大学园艺与植物保护学院	53	286	8.0	15.0
2	陶俊	扬州大学园艺与植物保护学院	106	1479	17.0	36.0
3	周春华	扬州大学园艺与植物保护学院	34	646	14.0	25.0
4	曹春燕	扬州大学园艺与植物保护学院	1	14	1.0	1.0
5	孔芬	扬州大学园艺与植物保护学院	3	24	2.0	3.0