西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布

• 作者: 于心科 李铁刚 王峰 萨仁高娃 马学恩
• 来源期刊: 地质学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 西太平洋 16S rDNA 沉积物多样性
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 1105-1111
• 分类号: P5
• 字数: 4623字
• 语种: 中文

摘要

以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱.据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析.结果表明,沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B (11.8%)、Marine Benthic Group D (13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group (68.69%)为主.少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group (1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group (1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E (0.18%).以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李铁刚	中国科学院海洋研究所海洋地质与环境重点实验室	95	907	16.0	27.0
2	于心科	中国科学院海洋研究所海洋地质与环境重点实验室	15	88	6.0	9.0
3	马学恩	内蒙古农业大学动物科学与医学学院	87	464	11.0	17.0
4	王峰	内蒙古农业大学动物科学与医学学院	43	138	8.0	9.0
5	萨仁高娃	中国科学院海洋研究所海洋地质与环境重点实验室	7	28	3.0	5.0