荧光定量PCR与LAMP检测IHHNV的特异性和灵敏性比较

• 作者: 任春华 冯娟 张吕平 江晓 胡超群 赵哲
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 荧光定量PCR LAMP IHHNV 特异性 灵敏度
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 984-989
• 分类号: Q-31
• 字数: 4410字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2010.00984

摘要

传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失.研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它们的特异性和灵敏性进行了比较.结果显示,所建立的荧光定量PCR检测IHHNV的方法最低检测限度为6个DNA拷贝/反应,在待扩增DNA浓度为6.038×104-6.038×109cps/mL,范围时,模板浓度与循环阈值Ct之间的相关性良好,决定系数r2为0.99521;对5份白斑综合症病毒基因组DNA和10份健康对虾基因组DNA样品进行荧光定量PCR检测,结果都为阴性;这说明荧光定量PCR检测IHHNV方法具有灵敏度高、特异性高和精确性高等优点.同样,所建立的LAMP检测IHHNV的方法在60min反应时间内也可榆测到最低为6个拷贝的DNA模板,反应产物加入荧光染料SYBR Green Ⅰ后反应液呈现明显的亮绿色,且特异的检测IHHNV DNA模板;这说明所建立的LAMP检测IHHNV的方法具有荧光定量PCR方法相当的灵敏度、特异性和精确性.考虑到LAMP检测方法操作更为简单、方便,而且不需要昂贵的仪器,LAMP检测IHHNV的方法更适合于对虾养殖现场检测的推广使用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡超群		74	1368	25.0	34.0
4	张吕平	中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室	25	515	14.0	22.0
5	任春华	中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室	23	546	14.0	23.0
6	冯娟	中国水产科学研究院南海水产研究所	71	1363	22.0	33.0
7	江晓	中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室	9	55	4.0	7.0
11	赵哲	中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室	8	54	3.0	7.0