石斛属植物DNA条形码序列的筛选

• 作者: 严海 李劲松 符岸军 黄海
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: DNA barcoding ITS marK trnH-psbA rbcL 石斛属
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 1769-1777
• 分类号: S682.31|Q78
• 字数: 4953字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.10.022

摘要

DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种新的物种鉴定技术,COI序列已成功应用于动物的鉴定,但目前国际上还没有找到一个通用序列能鉴定所有植物物种.为筛选出适合于石斛属的DNA条形码序列,本文首先应用Mega 4.0软件分析了石斛属的ITS、marK、trnH-psbA、rbcL序列的特征.然后运用Wilcoxon秩和检验比较不同序列的种内和种间变异性.运用Taxon DNA软件评估这4个序列的barcoding gap.分析结果表明:ITS序列不仅种内变异和种间变异最大,而且有明显的barcoding gap,种内变异和种间变异重合较少,能较好地区分不同种类的石斛,可考虑作为石斛属DNA barcoding鉴定候选序列之一;matK、trnH-psbA和rbcL序列都不适合于石斛属DNA barcoding鉴定.在所分析的4个候选序列中,没有任何一个单一序列能完全鉴别出不同种类的石斛属植物.建议采用不同序列组合进行石斛属DNA barcoding鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李劲松		88	650	14.0	19.0
2	严海		13	72	5.0	8.0
3	黄海		23	169	8.0	12.0
4	符岸军		4	38	3.0	4.0