甲型流感病毒血凝素基因历史进化规律

• 作者: 刘殿武 史艳 庞礴 张国平 徐保红 杨洁 田会方 郝冉
• 来源期刊: 中国预防医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 甲型流感病毒 亚型 血凝素基因 进化规律
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 886-890
• 页数: 5页
• 分类号: R183.3
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨甲型流感病毒不同亚型血凝素(HA)基因的历史进化演变规律.方法 从NCBI数据库中收集到140多个甲型不同亚型流感病毒株,涵盖人、猪、禽三个物种的不同历史时期及不同地区的病毒的HA基因序列.利用PHYLIP软件包对所选序列进行基因进化分析,构建NJ进化树;采用Clustal X软件对与2009年新型甲型H1N1流感病毒聚在同一进化分支的其他猪流感病毒的HA基因的氨基酸序列进行分析.结果 人类三种主要亚型H1N1、H2N2和H3N2具有不同的时间分布特征,表现为1957年之前,主要流行株为H1N1亚型,1957-1968年为H2N2亚型,从1968年起主要流行株为H3N2亚型和H1N1亚型共同在人间传播;从20世纪80年代起流感病毒物种间隔离现象逐渐模糊,陆续出现了猪/禽/人病毒混合感染的病例,H5N1亚型流感病毒物种间隔离最弱;2009年新型甲型流感病毒与猪H1N1流感病毒聚在一支,提示2009年波及全球的新型甲型流感病毒为猪H1N1亚型病毒造成的;氨基酸序列分析显示:2009年新型甲型流感病毒HA基因中共有13个特有的氨基酸变异位点,提示这些位点可能参与了猪和人H1N1亚型病毒物种隔离屏障的限制,其功能尚需进一步确定.结论 甲型流感病毒亚型间存在相互演化关系,不同物种间病毒混合感染的发生,病毒变异的机会增加.