番茄斑萎病毒属病毒S RNA序列比对

• 作者: 何婷婷 刘雅婷 孙文涛 徐小刚 李永忠 韩毅
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄斑萎病毒属 核壳体序列 SRNA上的非结构蛋白序列 抗性破坏
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 142-146
• 页数: 5页
• 分类号: S432.4+1
• 字数: 3230字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1238.2010.00142

摘要

从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间S RNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系统进化树显示CCSV和TZSV之间的同源性为85.8%,IYSV和TYRV之间的同源性达90%,MYSV和PSMV间的同源性为97.5%;通过N蛋白序列分析显示,Tospovirus属中有7组同源性较高的种;在Tospovirus属病毒中非极性氨基酸含量最高,极性酸性氨基酸最少,比较TSWV中抗性破坏RB株系与普通株系在NSs、N核酸、蛋白质序列、氨基酸含量和蛋白质二级结构之间的差异,发现差异不显著.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李永忠	云南农业大学烟草学院	61	648	15.0	22.0
2	刘雅婷	云南农业大学农学与生物技术学院	68	553	12.0	20.0
3	徐小刚	云南农业大学农学与生物技术学院	6	79	4.0	6.0
4	孙文涛	云南农业大学农学与生物技术学院	3	59	3.0	3.0
5	何婷婷	云南农业大学农学与生物技术学院	3	8	2.0	2.0
6	韩毅	云南农业大学农学与生物技术学院	2	4	1.0	2.0