准噶尔雅罗鱼β-肌动蛋白基因启动子克隆及序列分析

• 作者: 曹旭东 王远志 盛金良 胡文革 郝凤霞 陈创夫
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 准噶尔雅罗鱼 β-actin基因启动子 转录调控元件 内含子 系统发育
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 18-26
• 页数: 9页
• 分类号: Q751
• 语种: 中文

摘要

利用PCR方法克隆了准噶尔雅罗鱼(Leuciscus merzbacheri)的β-actin基因启动子片段SZ21,大小是2398 bp.对克隆的启动子序列进行了转录调控元件的生物信息学预测分析,同时,基于启动子中包含的开放阅读框和内含子序列,探讨了准噶尔雅罗鱼与鲤鱼(Cyprinus carpio)、草鱼(Ctenopharyngodon idella)、青鱼(Mylopharyngodon piceus)、团头鲂(Megalobrama amblycephala)、泥鳅(Misgurnus mizolepis)间的系统进化关系.结果显示,该启动子序列的3个核心启动子转录元件:CAAT-box、CArG motif和TATA-box分别在转录起始位点(+1)上游的-89、-59、-26处,序列中还含有MEF2、SATB、CHRF、INRE、MTEN、E-box、RU49、ZBPF、CREB、Enhance region、CEBP位点等多种转录调控元件.在剪接体内含子中,剪接位点遵循GT…AG法则.启动子SZ21序列含有3个内含子和155个氨基酸.内含子1、内含子2、内含子3的系统发育分析表明,团头鲂与草鱼和青鱼的亲缘关系要比与准噶尔雅罗鱼的更近一些,这与传统分类中的亲缘关系显示不一致,其原因尚需探讨.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	盛金良	石河子大学动物科技学院	40	223	6.0	14.0
2	王远志	石河子大学医学院	46	209	9.0	13.0
3	胡文革	石河子大学生命科学学院	37	347	10.0	17.0
4	陈创夫	石河子大学动物科技学院	192	732	14.0	17.0
5	郝凤霞	石河子大学生命科学学院	7	30	3.0	5.0
6	曹旭东	石河子大学医学院	25	84	6.0	8.0