豌豆蚜基因组P450基因家族的分析

• 作者: 刘静 张云华 张鹏飞 王强 陈建群
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 豌豆蚜 细胞色素P450 表达序列标签 正选择 基因转换 基序
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 849-856
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

细胞色素P450在各种内源和外源物质代谢中起着非常重要的作用.利用豌豆蚜Acyrthosiphon pisum基因组mRNA和氨基酸数据库研究P450基因功能的进化规律.通过生物信息学方法对豌豆蚜全基因组P450进行分析,结果显示:在豌豆蚜基因组中发现69个P450基因,它们分别属于13个P450家族和18个亚家族,是一个典型的多基因家族.进一步将这些摹因与豌豆蚜ESTs数据库进行了比对分析,其中39个候选基因有EST证据,证明了这些P450基因在转录水平的真实性.以氨基酸相似度大于60%为标准对豌豆蚜基因组中P450基因进行分组,69个P450基因中,除18个基因序列因差异太大,不能被归人任何一组,其余51个可归入10个组,其中8个组(包含47条序列)适合于正选择和基阒转换分析.正选择和基凶转换分析结果表明:仅有1个组(含9个基凶)显著受到正选择压力作用,正选择概率大于95%的氨基酸位点分别是20T和27N,20T位于底物识别位点SRSI,27N位于D-helix;有3个组(包含8个基因)显示显著的基因转换事件.参与基因转换的基因均为CYP4家族成员,分别是CYP4C,CYP4G和CYP4V亚家族.参与基因转换的成员之间的蛋白相似度较高(70%～95%),且XM_001944991与XM_001951794同存在于SCAFFOLD12542上,XM_001945510与XM_001944057同存在于SCAFFOLD7010上.这可能暗示豌豆蚜P450基因通过基因复制,然后通过基因转换使P450获得新的功能,以适应多变的生存环境.此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈建群	南京大学生命科学学院	28	547	13.0	23.0
2	王强	南京大学生命科学学院	106	816	13.0	26.0
3	张云华	安徽农业大学生命科学学院	52	534	11.0	21.0
5	刘静	南京大学生命科学学院	19	35	3.0	5.0
6	张鹏飞	南京大学生命科学学院	13	308	7.0	13.0