生物信息学研究揭示乳腺癌组织分化中可能的microRNA调控通路

• 作者: 张学工 王志敏 裴云飞 费菲 邵志敏 黄薇
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: microRNA 组织分级 乳腺癌 TGF-β通路
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 660-668
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1007/s11434-009-0559-7

摘要

microRNA(miRNA)被广泛报道能参与乳腺癌的病理发生发展过程.但是,在这些病理过程中,miRNA通过哪些信号通路来参与这些过程还不甚清楚.例如,在乳腺癌的组织学分级分化过程中,人们对于miRNA如何与其靶标基因相互作用来调控乳腺癌的分化还知之甚少.本研究通过计算的方法研究miRNA在乳腺癌组织学分级分化过程中的作用.通过寻找miRNA靶标基因集合在基因芯片数据中乳腺癌I级和Ⅲ级间显著差异表达,鉴定了15个候选miKNAs,其中9个关键的miRNAs通过调控差异表达的靶基因来参与6个重要的信号转导通路.在这些通路中,TGF-β信号通路中一个主要的抑制分子SMAD7蛋白被预测为上面几个关键miRNAs的靶标基因.SMAD7既能被miRNA直接调控又能被miRNA调控的信号通路调控,进而影响TGF.p信号通路在乳腺癌组织分化中的作用.因此,我们推测'rGF-β信号通路作为一个核心通路在miRNA调控乳腺癌的组织分化过程中起重要作用.预测靶标基因在乳腺癌Ⅰ级和Ⅲ级的分类性能在另外3个独立的乳腺癌数据集上得到进一步验证.3个预测差异表达的关键miRNAs也通过实时荧光定量PCR在10个不同组织分级的乳腺癌病人样本中得到验证.