转基因玉米EPSPS蛋白适体的筛选与结构分析

• 作者: Jun Sheng Lin 吴亚君 江树勋 潘大仁 邵碧英 陈敏 陈文炳 陈洪俊 黄新
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 转基因玉米 EPSPS蛋白 SELEX 适体 结构
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 600-604
• 分类号: Q81
• 字数: 3468字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.04.017

摘要

通过体外合成长度为70个碱基的随机ssDNA文库,采用指数富集配基的系统进化(SELEX)技术,以转基因玉米EPSPS蛋白为靶目标进行16轮筛选,将筛选到的适体群进行克隆、测序,初步获得与转基因玉米EPSPS蛋白特异性结合的适体.并用Macaw 2.05和DNAMAN软件对每个适体的保守序列和二级结构进行分析.结果表明:一级结构分析序列同源性可分为四大群,其中A群有11条序列含有67个保守碱基;二级结构分析结果表明,茎环状和口袋状等结构可能是适体与转基因玉米EPSPS蛋白结合的结构基础.利用SELEX技术获得与转基因玉米EPSPS蛋白特异结合的适体群,其一级和二级结构与亲和力密切相关.