南方根结线虫诱导辣椒基因CaRKNIF2的克隆与分析

• 作者: 茆振川 谢丙炎 邹学校 郑井元 陈国华
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: WRKY转录因子 CaRKNIF2 cDNA Southern杂交 基因表达
• 年，卷（期）: 2010,（24）
• 页码范围: 5046-5054
• 分类号: S6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.24.008

摘要

[目的]明确辣椒(Capsicum annuum L. HDA149)中与南方根结线虫(Meloidogyne incognita)不亲和互作过程中抗性相关WRKY转录因子的基因结构及其表达模式.[方法]采用RACE结合RT-PCR方法克隆cDNA序列,并根据cDNA序列设计特异引物扩增DNA序列,Southern杂交确定基因拷贝数,实时荧光定量PCR方法分析该基因在线虫侵染后辣椒的不同组织和不同时间点的表达.[结果]从辣椒中克隆到一个WRKY转录因子基因CaRKNIF2(GenBank登录号:GQ253367),该基因编码区全长1 662 bp,编码553个推定的氨基酸,为单拷贝基因.CaRKNIF2基因编码区全长DNA序列2 530 bp,包含5个内含子和6个外显子.在线虫接种诱导处理时,该基因表达具有组织特异性,根尖组织中的表达量最高;接种3 h后在根尖组织中的表达量开始升高,12 h最高,此时相对表达量约为3.1倍.[结论]CaRKNIF2在线虫接种处理后的表达上调,表明该基因参与了抗性基因Me3介导的辣椒与根结线虫的不亲和互作,可能在此过程中具有重要功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢丙炎	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	175	3639	30.0	51.0
2	邹学校		13	65	6.0	7.0
3	茆振川	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	40	564	12.0	22.0
4	陈国华	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	50	267	10.0	12.0
5	郑井元		1	6	1.0	1.0