幽门螺杆菌硫氧还蛋白两种不同亚型基因序列的测定及分析

• 作者: 丁士刚 刘琳娜 张静 王晔 石岩岩 陈香梅 鲁凤民
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 螺杆菌,幽门 硫氧还蛋白 基因 氨基酸类 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（40）
• 页码范围: 2830-2833
• 分类号: R3
• 字数: 3917字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2010.40.007

摘要

目的 测定不同胃疾病分离的幽门螺杆菌(Hp)临床菌株中硫氧还蛋白(Trx)1、2基因序列,并确定其氨基酸序列,探讨其与相关疾病的关系.方法 通过胃镜获取慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌3种疾病共25例患者的胃黏膜组织,从中分离培养Hp菌株,提取基因组DNA.根据GenBank基因组中Hp基因序列设计Trx1、Trx2引物,应用聚合酶链反应(PCR)进行扩增,对扩增产物进行序列测定及生物信息学分析,并与国际标准菌株比对.结果 应用PCR的方法成功扩增出Trx1全基因序列及Trx2基因前295核苷酸.应用BioEdit软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析,不同疾病分离的Hp Trx1均含有321个核苷酸,总突变位点率13.4%(43/321);编码106个氨基酸,含有一个Cys-Gly-Pro-Cys氧化还原活性位点,25例不同胃疾病Hp TRX1的氨基酸同源性高达97.2%(103/106).Trx2的前295个核苷酸,总突变位点率18.6%(55/295);编码的氨基酸无Cys-Gly-Pro-Cys,含有一个CXXC区域,氨基酸同源性为84.7%(83/98).结论 Hp临床分离菌株的Trx两个亚型核苷酸序列均有不同程度的位点突变,但氨基酸的序列同源性较高,均为无效突变.不同疾病分离的Hp Trx1均含有一个Cys-Gly-Pro-Cys氧化还原活性位点,TRX2仅含有一个CXXC区域.研究结果为进一步探讨Hp Trx的生物学功能及其致病机制提供了可靠依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张静	北京大学第三医院消化科	216	2159	26.0	41.0
2	丁士刚	北京大学第三医院消化科	141	1812	23.0	36.0
3	刘琳娜	北京大学第三医院消化科	21	148	6.0	11.0
4	王晔	北京大学第三医院消化科	44	509	12.0	21.0
5	鲁凤民	北京大学医学部病原生物学系	61	269	7.0	13.0
6	陈香梅	北京大学医学部病原生物学系	21	76	5.0	7.0
7	石岩岩	北京大学第三医院消化科	40	127	6.0	10.0