不结球白菜抗芜菁花叶病毒蛋白BcTuRsO的生物信息学分析

• 作者: 侯喜林 刘同坤 单晓政 孙菲菲 肖栋 马景蕃
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 不结球白菜 抗病毒蛋白BcTuRsO 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 280-285
• 分类号: Q811.4
• 字数: 4868字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2010.02.010

摘要

采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)蛋白BcTuRsO的系统进化、理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位、所含模体及蛋白质结构进行预测和分析.系统进化树分析结果表明,该蛋白在不同物种之间具有保守性.理化性质分析结果显示该酶含194个氨基酸,分子量为21 731.3,理论等电点pl值为6.60.TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本重叠.用Target P server和WOLFPSORT server程序预测该蛋白为细胞质蛋白.结构域分析结果显示该蛋白含多种磷酸化位点.二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主.