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小溪自然保护区非盐环境土壤中嗜盐和耐盐菌多样性
小溪自然保护区非盐环境土壤中嗜盐和耐盐菌多样性
作者:
刘祝祥
张丽
彭清忠
李文均
贺建武
陈义光
陈奇辉
黄苛
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
普通非盐土壤
嗜盐和耐盐细菌
纯培养法
16S rRNA基因序列
系统发育分析
摘要:
[目的]研究湖南小溪国家级自然保护区普通非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤样品中可培养嗜盐及耐盐细菌(含放线菌)多样性.[方法]采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中嗜盐及耐盐细菌多样性进行研究.[结果]用补充5%-20%(w/v)NaCl的MA、ISP 2、ISP 5、NA和HAA培养基从土壤样品中分离到114株细菌,其中8株为中度嗜盐菌,19株为轻度嗜盐菌,87株为耐盐菌.根据形态观察和部分生理生化实验结果去冗余,选取61个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析.结果表明,这些菌株属于细菌域(Bacteria)的3个大的系统发育类群(门;phylum)(Actinobacteria,Firmieutes,Proteobacteria)的16个科、18个属,代表了41个物种.多数菌株属于Firmicutes门(38株,62.3%)和Actinobacteria门(18株,29.5%).大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S rRNA基因序列相似性为96.9%-99.8%),其中有7个菌株(JSM070026,JSM 081004,JSM 081006,JSM 081008,JSM 083058,JSM 083085,JSM 084035)代表7个潜在新种(potential novel species).[结论]研究结果表明,湖南小溪国家级自然保护区普通非盐环境土壤中存在较为丰富的可培养嗜盐及耐盐细菌多样性,并且潜藏着较多新的微生物类群(物种).
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小溪自然保护区非盐环境土壤中嗜盐和耐盐菌多样性
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微生物学报
学科
生物学
关键词
普通非盐土壤
嗜盐和耐盐细菌
纯培养法
16S rRNA基因序列
系统发育分析
年,卷(期)
2010,(11)
所属期刊栏目
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1452-1459
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Q939
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微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
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15
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国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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