日本蟳线粒体16SrRNA和COI基因序列比较分析

• 作者: 刘萍 李健 潘鲁青 陈萍 高俊娜 高保全
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 日本蟳 16S rRNA基因 COI基因 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 57-63
• 分类号: Q953
• 字数: 3964字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2010.12.009

摘要

对采自莱州湾和胶州湾的日本蟳野生群体的线粒体16S rRNA和COI基因片段进行了PCR扩增和测序,分别得到长度为519和658 bp的碱基序列.研究结果显示这2个基因片段在种内的变异都较低,对2个基因同源序列分析表明,在线粒体16SrRNA基因片段中共检测到7个变异位点(包括6个单一变异位点,1个简约信息位点)和7种单倍型;在COI基因中共检测到8个变异位点(包括6个单一变异位点,2个简约信息位点)和7种单倍型.通过统计变异位点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数,分析比较了两群体间的序列差异和遗传多样性水平.结果显示2个日本蟳野生群体的遗传多样性比较丰富.用MEGA4.0软件构建了NJ和UPMGA系统树,基于16SrRNA基因片段的系统树显示梭子蟹科的4个属聚为两大支:日本蝇不同的单倍型先聚在一起,然后与青蟹属的3种蟹聚为一支;梭子蟹属的三疣梭子蟹、远海梭子蟹及塞氏梭子蟹聚在一起;再与美青蟹属的美洲蓝蟹、巴西蓝蟹等聚为一支.基于COI基因显示日本蟳不同的单倍型先聚在一起,再与其他3种蟳聚为一支;梭子蟹属的远海梭子蟹和三疣梭子蟹相聚,然后与美青蟹属的2种蟹相聚为一支.该结果与传统分类一致.这些数据为我国日本蟳的种质资源保护和利用提供了基础的分子生物学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	李健	中国水产科学院黄海水产研究所	215	3950	34.0	49.0
3	高保全	中国水产科学院黄海水产研究所	41	687	16.0	24.0
4	潘鲁青		102	1937	24.0	39.0
5	陈萍	中国水产科学院黄海水产研究所	29	373	13.0	17.0
6	高俊娜	中国水产科学院黄海水产研究所	2	15	2.0	2.0