藻类△6脂肪酸脱饱和酶基因密码子偏好性分析

• 作者: 王明兹 赵薇 陈必链 黄建忠
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 藻类 △6脱饱和酶基因 密码子偏好性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 126-134
• 分类号: P735.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2010.03.021

摘要

△6脂肪酸脱饱和酶是在长链脂肪酸18C位置上引入双键的关键酶.本文分析硅藻门、绿藻门和蓝藻门等藻类的△6脂肪酸脱饱和酶基因密码子偏好及碱基位置偏好, 同时比较藻类△6脂肪酸脱饱和酶基因与大肠杆菌、酵母及拟南芥基因组的密码子偏爱性.结果发现, 硅藻门T. pseudonana与P. tricornutum及绿藻门Ostreococcus tauri △6脂肪酸脱饱和酶基因明显偏爱使用以G或C结尾的密码子, GC含量高达61.61%.蓝藻门三种藻△6脂肪酸脱饱和酶基因与之相反, 偏爱A或U结尾的密码子, GC含量仅为39.1%.所选9条不同藻类的△6脱饱和酶基因密码子偏好不明显, 说明藻类物种间差异对△6脱饱和酶基因密码子偏好性的影响较小, 在进化上较为保守.然而, 藻类△6脱饱和酶基因密码子用法与大肠杆菌、酵母和拟南芥的△6脱饱和酶基因密码子用法差异较大, 若要实现该基因在以上宿主中的高效表达则需对部分密码子进行改造.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄建忠	福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院	125	695	15.0	20.0
2	陈必链	福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院	75	1035	18.0	27.0
3	王明兹	福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院	56	879	18.0	28.0
4	赵薇	福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院	2	15	2.0	2.0