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家蚕神经肽基因的筛查及成熟肽的预测
家蚕神经肽基因的筛查及成熟肽的预测
作者:
何宁佳
刘喜龙
梁九波
甘玲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
家蚕
神经肽
基因筛查
成熟肽
酰胺化
环化
硫酸化
信息分析
摘要:
神经肽(neuropeptide)是家蚕Bombyx mori体内重要的调控物质.为了充分理解神经肽对家蚕发育的调控,扩充家蚕神经肽的数量,本研究利用BLAST的tblastn程序结合OpenOffice软件的查找程序,基于其他昆虫和无脊椎动物神经肽的同源性和保守的结构特点,在家蚕基因、理论蛋白质数据库及NCBI中进行全面而系统的基因筛查;并利用各种在线工具对所筛查到基因和理论蛋白质的结构和成熟肽进行预测分析.结果共获得allatostatin-A(AST-A),allatostatin-B(AST-B),allatostatin-C(AST-C),allatropin(AT),ecdysis-triggering hormone(ETH),crustacean cardioactive peptide(CCAP)和FMRFamide等31个神经肽基因家族,包括37个神经肽基因亚家族,共计44个神经肽基因;预测出193个成熟的神经肽,其中73个根据家族同源性预测在C末端发生酰胺化,而6个被预测在N末端发生了环化,9个被预测酪氨酸发生了硫酸化.大部分成熟神经肽都具有明显的家族结构特征,但proctolin,CCAP及CAPA-PK成熟肽结构上与其他昆虫相比有所扩展.结果提示,家蚕神经和内分泌细胞产生了几乎在所有昆虫中具有的神经肽前体;进化过程中大部分成熟神经肽的氨基酸序列在种间产生了差异,但家族特征性基序高度保守.本研究为神经肽功能研究以及神经肽对家蚕发育尤其是蛹期发育调控的研究奠定了基础.
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篇名
家蚕神经肽基因的筛查及成熟肽的预测
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
家蚕
神经肽
基因筛查
成熟肽
酰胺化
环化
硫酸化
信息分析
年,卷(期)
2010,(1)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
9-19
页数
11页
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
甘玲
西南大学蚕学与系统生物学研究所农业部蚕桑学重点开放实验室
15
17
1.0
4.0
2
何宁佳
西南大学蚕学与系统生物学研究所农业部蚕桑学重点开放实验室
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6.0
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3
梁九波
西南大学蚕学与系统生物学研究所农业部蚕桑学重点开放实验室
5
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刘喜龙
西南大学蚕学与系统生物学研究所农业部蚕桑学重点开放实验室
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研究去脉
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昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
49239
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
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