斜带石斑鱼胰蛋白酶原和淀粉酶全长cDNA的克隆与序列分析

• 作者: 刘秀霞 张海发 李观贵 梁旭方 王云新 王琳 胡永乐
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 胰蛋白酶原 淀粉酶 基因克隆 序列分析 斜带石斑鱼Epinephelus coioides
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 125-131
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2010.05.019

摘要

采用RT-PCR及RACE法从斜带石斑鱼Epinephelus coioides肝胰脏克隆得到胰蛋白酶原(trypsinogen,TRY)与淀粉酶(amylase,AMY)基因cDNA全序列.斜带石斑鱼肝胰脏TRY基因cDNA全长911 bp,其中5非翻译区(5'-UTR)为55bp,3'-UTR为127bp,开放阅读框(ORF)为729bp,编码242个氨基酸,包含所有丝氨酸蛋白酶中共有的高度保守的催化活性中心.序列一致性分析发现,斜带石斑鱼与牙鲆Paralichthys olivaceus、金头鲷Sparus aurata、鳎Solea senegalensis、石鲽Pleuronectes bicoloratus的TRY序列相似性高达86.8%-89.70%,与人Homo sapiens小鼠Mus musculus、斑马鱼Danio rerio的TRY相似性较低为59.9%-64.5%.斜带石斑鱼AMY基因cDNA全长1657bp,其中5'-UTR为41bp,3'-UTR为77 bp,ORF为1539bp,编码512个氨基酸,包含与哺乳动物α-AMY二级结构相似的8个α旋和8个β折叠.序列一致性分析发现,斜带石斑鱼与澳洲肺鱼Neoceratodus forsteri、美洲拟鲽Limanda americanus、大西洋鲑Salmo salar、斑马鱼AMY基因序列相似性高达82.4%-91.8%,与人、小鼠、鸡G.Gallus的AMY基因相似性较低为70.1%-72.3%.斜带石斑鱼TRY和AMY基因cDNA全序列的成功克隆为进一步研究其表达调控机理及研发有效提高其表达水平的饲料添加剂奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁旭方	暨南大学生命科学技术学院	96	622	13.0	17.0
2	刘秀霞	暨南大学生命科学技术学院	11	119	7.0	10.0
3	王琳	暨南大学生命科学技术学院	55	376	11.0	16.0
4	李观贵	暨南大学生命科学技术学院	13	62	6.0	7.0
5	张海发		54	732	16.0	24.0
6	王云新		38	623	13.0	24.0
7	胡永乐	暨南大学生命科学技术学院	10	65	6.0	7.0