中华鳖体表和体内菌群多样性分析

• 作者: 李太武 李登峰 胡广洲 苏秀榕 贺静静
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 中华鳖 16S rDNA RFLP 细菌多样性
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 393-398
• 分类号: S966.5
• 字数: 6112字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1111.2010.07.003

摘要

采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库.从2个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用Hae Ⅲ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树.在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13种和10种RFLP谱型,分别挑选了70个和60个克隆子进行测序.结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为15类和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌和变形菌,并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡广洲		1	3	1.0	1.0
2	李登峰		1	3	1.0	1.0
3	苏秀榕		1	3	1.0	1.0
4	李太武		1	3	1.0	1.0