人类基因组CpG岛甲基化概况的预测

• 作者: 凡时财 张学工 徐红兵 邹见效
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: DNA甲基化 CpG岛 预测模型 特征选择
• 年，卷（期）: 2010,（14）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1329-1334
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1007/s11434-009-3731-1

摘要

CpG岛甲基化在细胞的各种生物过程中扮演着重要角色.开发了预测人类基因组CpG岛甲基化状态的计算模型,获得了目前最好的预测性能,并用此模型对人类全基因组的CpG岛甲基化状况进行了预测.根据预测结果,约31%的CpG岛处于甲基化状态,而位于启动子区的CpG岛则倾向于不被甲基化.染色体R带和G带中CpG岛的甲基化水平没有显著差异.基因启动子区内,不易被甲基化的CpG岛中RNA聚合酶的结合强度显著高于易被甲基化的CpG岛,表明包含不易被甲基化的CpG岛的启动子对应的基因具有更高的表达活性.