AB SCIEX TripleTOF 5600在蛋白质组学研究中的应用

• 作者: Brigitte Simons Cllristie Hunter 谢永明 郭立海 靳文海 高醇新
• 来源期刊: 现代仪器与医疗
• 关键词: TripleTOF 5600 高分辨质谱 高通量 序列覆盖率 高分辨定量分析
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 6-10,24
• 分类号: Q5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-7916.2010.05.002

摘要

AB SCIEX公司最新发布全新的高分辨液相色谱质谱联用系统--TripleTOF5600是在享有盛名的API 5500三重四极杆系统和QSTAR Elite(QqTOF)系统这两个技术平台的基础上开发出来的.TripleToF 5600高分辨液相色谱质谱联用系统能够对复杂的蛋白质组学样品进行高通量分析,并能同时提供高质量的定性和定量结果.为评估这款仪器的性能,设计基于纳升液相色谱和TripleTOF 5600联用系统的一系列实验.首先,应用这一拥有高分辨率、高灵敏度和高质量准确度的系统对酵母细胞裂解物的胰酶消化产物进行分析.实验中采用每秒最多采集50幅串联质谱谱图的信息相关采集模式,单次LC-MS/MS实验就鉴定10179条独特肽段和1174种蛋白(at 1%global false discoveryrate).而实际达到平均每秒34幅串联谱图的采集速度是在单次实验获得如此优异的鉴定结果的决定性因素.此外,也对一组含有5种已知蛋白以及部分重同位素标记肽段的样品进行分析,以检验TripleTOF 5600的定量能力.实验中这5种蛋白质都获得很高的序列覆盖率,其中进样量仅有100amol的Peroxiredoxin 1蛋白的序列覆盖率也高达53%.而测试中得到肽段的平均质量偏差仅为1.7 ppm,展示TripleTOF 5600的高质量准确度和稳定性.此外还获得高度准确的定量结果,充分证明TripleTOF 5600能够提供三重四极杆系统级别的定量结果.