Ceratotropis亚属基于SSR标记和ITS序列的分类与进化分析

• 作者: 王丽侠 王素华 程须珍 赵丹 马燕玲
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: Ceratotropis亚属 分类 SSR标记 ITS序列 进化
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 1585-1595
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01585

摘要

利用SSR分子标记和ITS序列分析研究Ceratotropis亚属已鉴定的93份种质以及Vigna亚属的2份地方种和Glycine属的1份野生种,共8个种及亚种的96份材料的遗传差异.初步筛选出分布于11个连锁群(linkage group,LG)的74对小豆引物及14对黑吉豆引物和第9连锁群的5对绿豆引物,得到分辨力强的27对引物,平均PIC值为0.4914;UPGMA聚类分析,在DICE系数0.021处,将95份参试材料(除HAI_103)划分为两大类,第Ⅰ类包括Ceratotropis组所有种质和3个"过渡"种质;第Ⅱ类包括Angulares组所有种质,且小豆引物通用性最高,23对小豆引物的转移能力达88%以上.对参试材料中的28份典型种质进行ITS测序分析,比较序列间Kimura进化距离发现,V.minima和V.umbellata种间距离最小(0～0.005),V.radiata种内分化程度最高;利用MEGA4.0构建最大简约树(maximum parsimony,MP)和邻接树(neighbor-joining,NJ),将参试种质划分为3大类,这与形态学和SSR标记分类一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵丹	中国农业科学院作物科学研究所	23	150	6.0	11.0
2	程须珍	中国农业科学院作物科学研究所	67	826	19.0	24.0
3	王丽侠	中国农业科学院作物科学研究所	46	601	16.0	23.0
4	王素华	中国农业科学院作物科学研究所	48	642	17.0	23.0
5	马燕玲	中国农业科学院作物科学研究所	6	26	2.0	5.0